بررسی چند شکلی تک نوکلئوتیدی و توالی های ریزماهواره ای در واریته های مختلف برنج با استفاده از نشانگرهای مبتنی بر and

نویسندگان

mojtaba najafi

phd student in animal breeding and genetics, sari agricultural sciences and natural resources university, sari , iran ghodrat rahimi

. zarbakht ansari

. mohammad ali rouhi

.

چکیده

در پژوهش حاضر، نشانگرهای مولکولی مختلف مبتنی بر dna برای شناسایی چند شکلی تک نوکلئوتیدی و توالی های میکروساتالایت برای ژن واکسی در واریته های برنج مورد بررسی قرار گرفت. استخراج dna از نمونه های برگی 68 رقم برنج با استفاده از روش ctab انجام گرفت و پرایمرهای اختصاصی برای تکثیر ژن واکسی طراحی گردید. بعد از تکثیر قطعات مورد نظر با استفاده از pcr، توسط تکنیک منحنی ذوب، تعیین ژنوتیپ صورت گرفت. برای تایید نتایج تعیین ژنوتیپ با آنالیز منحنی ذوب دو روش pbr و pcr-sscp برای جایگاه ژن واکسی مورد استفاده قرار گرفتند. نتایج دو ژنوتیپ tt و gg را در ژن واکسی نشان داد که با نتایج بدست آمده از دو روش pbr و pcr-sscp کاملا مطابقت داشت. فراوانی ژنوتیپ های tt و gg به ترتیب 25 و 75 درصد برآورد شد. هم چنین، نه ژنوتیپ مختلف شامل bh، hh، ff، dd، cc، ee، bb، aa و eg در نشانگر ssr شناسایی شد که نشان دهنده تنوع ژنتیکی بالا در واریته های مختلف برنج مورد مطالعه می باشد. اگرچه همبستگی چند شکلی g-t با صفات معنی دار نشد، ولی همبستگی معنی داری بین ژنوتیپ های مشاهده شده در نشانگر ssr با صفات gw، tgw و  fgn به دست آمد. نتایج این مطالعه نشان داد که تکنیک آنالیز منحنی ذوب به عنوان یک روش سریع و کارآمد و ارزان می تواند به منظور تعیین ژنوتیپ مورد استفاده قرار گیرد. هم چنین، نتایج حاصله از نشانگر ssr نشان داد این نشانگر یک نشانگر کارآمدی برای برخی از صفات اقتصادی در به نژادی واریته های برنج می باشد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

بررسی تنوع مولکولی توده‌های مختلف برنج هاشمی شمال کشور با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

 توده­های محلی برنج ایران از دیرباز در نقاط مختلف برنج­خیز کشور کشت می­­شوند. این توده­ها طی سالیان متمادی به شرایط محیطی مختلف سازگار شده­اند و در نتیجه تنوع نسبتاً زیادی ممکن است در هر کدام از توده­ها مشاهده شود. از چندین سال پیش تا کنون، کشت رقمی به نام هاشمی که از ارقام محلی برنج ایرانی است، رایج شده است، به­طوری­که بیشتر سطح زیر کشت استان گیلان و بخشی از نواحی استان مازندران و حتی برخی از ا...

متن کامل

نقشه یابی ژن های اعاده کننده باروری (Rf) در برنج با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

ارقام هیبرید حاصله از سیستم نرعقیمی WA حدود 90% تولید برنج هیبرید را در برمی‌گیرند. اکثر مطالعات نشان داده است که اعاده کنندگی باروری در این سیستم توسط دو ژن مستقل کنترل می‌شود. عدم اطلاع صحیح از ژنتیک ژن یا ژن‌های اعاده کننده باروری برای سیتوپلاسم نوع WA، هنوز آن را به صورت مسئله‌ای حل نشده باقی گذاشته است. برای شناسایی ژنهای اعاده کننده باروری (Rf)، جمعیت 2F حاصل از تلاقی IR58025A و IR42686R ...

متن کامل

بررسی تنوع و ویژگی های ژنتیکی تعدادی از توده برنج رقم هاشمی با استفاده از صفات مورفولوژیک و نشانگرهای ریزماهواره

برنج مهم‌ترین منبع غذایی بیش از نیمی از جمعیت جهان است. برنج هاشمی در حال حاضر در استان گیلان بیشترین میزان سطح زیر کشت را داشته و از لحاظ کیفیت پخت و مشتری پسندی بهتر از سایر ارقام می باشد. در این تحقیق به‌منظور بررسی تنوع ژنتیکی موجود در 20 توده محلی برنج هاشمی به‌همراه ارقام شاهد گوهر و هاشمی (معرفی‌شده توسط مؤسسه تحقیقات برنج کشور)، از 21 نشانگر ریز‌ماهواره، صفات مورفولوژیک و کیفیت دانه است...

متن کامل

بررسی تنوع و ویژگی های ژنتیکی تعدادی از توده برنج رقم هاشمی با استفاده از صفات مورفولوژیک و نشانگرهای ریزماهواره

برنج مهم‌ترین منبع غذایی بیش از نیمی از جمعیت جهان است. برنج هاشمی در حال حاضر در استان گیلان بیشترین میزان سطح زیر کشت را داشته و از لحاظ کیفیت پخت و مشتری پسندی بهتر از سایر ارقام می باشد. در این تحقیق به‌منظور بررسی تنوع ژنتیکی موجود در 20 توده محلی برنج هاشمی به‌همراه ارقام شاهد گوهر و هاشمی (معرفی‌شده توسط مؤسسه تحقیقات برنج کشور)، از 21 نشانگر ریز‌ماهواره، صفات مورفولوژیک و کیفیت دانه است...

متن کامل

بررسی تأثیر فراوانی‌های مختلف آللی بر اجزای واریانس ژنومی وزن بدن گوسفند سافوک با استفاده از داده‌های چند شکلی تک نوکلئوتیدی

نشانگرهای تک‌نوکلئوتیدی تمامی جایگاه‌های صفات کمی را تحت پوشش قرار داده و به طور بالقوه تمام واریانس ژنتیکی را توجیه می‌کنند. در این پژوهش از SNPهای گوسفندان سافوک استرالیایی که با تراشه نشانگری 50k شرکت ایلومینا، تعیین ژنوتیپ شده بودند، به منظور برآورد اجزای واریانس ژنومی، استفاده شد. صفات مورد بررسی وزن تولد و وزن شیرگیری بودند. کنترل کیفیت برای فراوانی آللی کمیاب (MAF) در دو آستانه یک و پنج ...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی ارقام برنج ایرانی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره پیوسته با ژن های مقاومت به خشکی

چکیدهاین تحقیق به منظور بررسی تنوع ژنتیکی مجموعه ای از 20 رقم برنج ایرانی، با استفاده از 19 نشانگر ریز ماهواره پیوسته با ژنهای کنترل¬کننده تحمل به خشکی، انجام گرفت. همچنین شاخص مقاومت به خشکی به عنوان یک صفت تکمیلی مهم در مرحله رسیدگی دانه در 20 رقم و دو محیط (تحت تنش و بدون تنش) ، مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج تجزیه واریانس مرکب نشان داد که بین ژنوتیپ¬ها از لحاظ صفت شاخص مقاومت به خشکی، اختلاف...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
iranian journal of genetics and plant breeding

جلد ۵، شماره ۱، صفحات ۱-۷

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023